神经系统疾病国家临床医学研究中心

China National Clinical Research Center for Neurological Diseases

科研进展

颅底脊索瘤全基因组学及其与患者预后关系研究

Data:2021-02-03 11:36
国家神经系统疾病临床医学研究中心张亚卓教授率领团队在国内外率先开展了颅底脊索瘤的全基因组与转录组测序工作,发现PBRM1是颅底脊索瘤显著突变驱动基因,PBRM1基因是染色质重塑复合物SWI/SNF的核心组份之一,PBRM1连同SETD2的突变以及结构变异是颅底脊索瘤中最常见的基因组事件。SWI/SNF复合物的改变联合染色体22q局部缺失与患者复发快、生存期短密切相关。该研究还显示,尽管脊索瘤的突变负荷整体较低,但是体细胞拷贝数变异(SCNAs)普遍存在;并且通过对配对的原发和复发脊索瘤进行研究,也发现SCNAs在原发和复发肿瘤中无差异,因此SCNAs在脊索瘤发生发展中扮演了重要角色。该研究结果不但为揭示颅底脊索瘤的发病机制奠定了坚实的基础,也为临床判断预后、寻找潜在靶向药物提供了依据。相关研究结果于2021年2月3日以“Whole genome sequencing of skull-base chordoma reveals genomic alterations associated with recurrence and chordoma-specific survival”为题发表于Nature Communications期刊(影响因子14.919)
10例颅底脊索瘤患者PBRM1变异总结:a. 5例非同义突变,每条竖线代表一例患者的突变位置,彩色方块代表蛋白功能结构域;b. 5例结构变异,不同的颜色代表不同的结构变异类型。
  
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33536423/